| [Gość (112.0.*.*)]odpowiedzi [Chiński ] | Czas :2022-08-30 | | Na przykład, zgodnie z wyborem 52 cech morfologicznych, cech cytologicznych i cech chemicznych żeń-szenia, 10 gatunków i wariantów żeń-szenia chińskiego zbadano numerycznie, co dodatkowo udowodniło, że rozsądne jest, aby badania klasyfikacji chemicznej podzieliły żeń-szeń na dwa taksony. Taksonomia numeryczna wykorzystuje komputerową analizę statystyczną do obiektywnego porównania relacji między różnymi grupami danych, rekonstrukcji relacji ewolucyjnej i oceny ewolucyjnego trendu cech i narządów poprzez istniejące dane informacji o roślinach. |
| [Gość (112.0.*.*)]odpowiedzi [Chiński ] | Czas :2022-08-30 |  Taksonomia liczb
Klasyfikacja numeryczna jest metodą klasyfikacji mikroorganizmów, które należy sklasyfikować według stopnia podobieństwa ich cech zgodnie z analizą numeryczną za pomocą komputerów.
(1) Główne zasady klasyfikacji numerycznej
Główne zasady klasyfikacji prawa to: (1) Każda cecha jest uważana za równie ważną przy klasyfikacji, aby uniknąć subiektywnego błędu klasyfikatora i uczynić wyniki bardziej obiektywnymi. (2) Klasyfikuj według jak największej liczby cech, aby ujawnić prawdziwy związek między jednostkami klasyfikacyjnymi. (3) Sklasyfikowany jako takson równoważny według podobieństwa cech.
2) Podstawowa procedura klasyfikacji numerycznej
Podstawowa procedura taksonomii numerycznej jest następująca:
(1) Wybór obiektów i cech klasyfikacji: W przypadku klasyfikacji numerycznej obiektem klasyfikacji może być szczep lub może to być gatunek lub rodzaj, więc każdy obiekt klasyfikacyjny nazywany jest operacyjną jednostką klasyfikacyjną. W wielu przypadkach OTU odnosi się do szczepu. Przy klasyfikacji numerycznej szczepy powinny być starannie dobrane zgodnie z celem pracy, który musi obejmować szczepy wzorcowe taksonów związanych z taksonem. Jeśli to możliwe, nowo wyizolowane szczepy powinny być również włączone do szczepów, które różnią się od tych w różnych częściach świata.
Aby osiągnąć cel bardziej obiektywnego i precyzyjnego rozróżnienia, cechy wyboru powinny wynosić jak najwięcej, zwykle nie mniej niż 50, a nawet setki, a nawet setki. Ogólnie rzecz biorąc, im większa liczba wybranych cech, tym bardziej wiarygodne wyniki klasyfikacji. Wybrane cechy powinny być jak najszersze i jednolite w badanych mikroorganizmach, morfologiczne, fizjologiczne i biochemiczne, ekologiczne, immunologiczne, genetyczne i inne. Należy jednak zauważyć, że nie należy wybierać cech bez znaczenia i cech jednorodnych, a cech pokrewnych, takich jak kinestetyczność i wiciarka, nie można wybierać w tym samym czasie.
(2) Kodowanie cech rejestruje obserwowane i mierzone cechy za pomocą symboli, które mogą być rozpoznane i obliczone przez komputer. Biorąc pod uwagę najczęściej używane cechy dwustanowe w klasyfikacji, takie jak to, czy źródło węgla jest używane, czy nie, czy istnieje określony enzym, czy może rosnąć w temperaturze 45 ° itp., Jako przykład, pozytywny wynik (może wykorzystywać pewne źródło węgla, ma pewien enzym, może rosnąć w temperaturze 45 ° itp.) jest reprezentowany przez " ", a wynik ujemny jest reprezentowany przez "-". Jeśli informacje są brakujące lub podejrzane, można je wskazać za pomocą "NC". W przypadku ilościowych cech polimorficznych lub jakościowych cech polimorficznych stosuje się ważoną metodę kodowania przyrostowego w celu przekształcenia jednej cechy polimorficznej w wiele cech 3-stanowych. Po zakodowaniu cech są one układane w numery sekwencyjne, tworząc macierz cech (surowe dane), która jest następnie wprowadzana do komputera..Komputer jest wprowadzany odpowiednio z 1 i 0, a "NC" jest reprezentowany przez "3" podczas wprowadzania komputera...
(3) Obliczanie współczynnika podobieństwa: Współczynnik podobieństwa jest miarą ogólnego podobieństwa między porównywanymi parami OTU, która jest obliczana zgodnie z podobieństwem każdej pary cech. Istnieje wiele sposobów obliczania podobieństwa, z których najprostszym jest obliczenie liczby podobieństw między dualnościami.
Jego wzór obliczeniowy jest następujący: S = NS / (NS ND)
NS w powyższym równaniu wskazuje, że porównywane pary OTU mają taką samą liczbę cech, a ND reprezentuje liczbę porównywanych par OTU, które mają różne cechy. Obliczone podobieństwo wyraża się w procentach lub proporcjach.
(4) Systematyczne grupowanie (lub grupowanie hierarchiczne): Systematyczne (lub hierarchiczne) grupowanie OTU zgodnie ze współczynnikiem podobieństwa w celu uzyskania macierzy podobieństwa, czyli macierzy S. Na przykład, jeśli 10 szczepów jest klasyfikowanych numerycznie, macierz S można uzyskać poprzez systematyczne grupowanie, a podobieństwo jest procentem, a 100 wskazuje, że każdy OTU porównuje się z samym sobą.
(5) Reprezentacja wyników grupowania: Korelacja między tymi 10 szczepami nie może być widoczna z macierzy, więc macierz musi zostać ponownie przetworzona, a wysokie i niskie podobieństwo są wymienione razem, aby uzyskać inny zestaw macierzy.
Macierz ta jest następnie przekształcana w widmo dendrytyczne, które pokazuje wzajemne relacje tych 10 szczepów. Klasyfikacja numeryczna daje grupę epitetyczną. Praktyka dowiodła, że pozorne grupy są równoważne taksonom. Pozorne grupy o podobieństwie około 75% można uznać za ten sam gatunek, a te o stosunku większym niż 65% można sklasyfikować jako ten sam rodzaj. Takie wnioski są zwykle zgodne z wynikami tradycyjnych metod klasyfikacji. |
|
